La vigencia del anexionismo tiene sus causas en el desarrollo histórico de nuestra sociedad y las características de los grupos dominantes, fundamentalmente conservadores. El convencimiento de que era imposible salir adelante sin ayuda de una potencia, se relaciona con las debilidades en el desarrollo de la conciencia nacional.
Origen del anexionismo dominicano.
La situación de permanente crisis en la economía había mantenido la ideología anexionista. El sector político que había estado en sectores carentes de conciencia nacional y predominantemente colonialista, lo que impedían formar un proyecto netamente nacional. Estos sectores creían que no podrían echar adelante un proyecto social sin la ayuda de una potencia colonial. Ademas, extrañaban aspectos como los siguientes:

* La diferencia social propia del sistema colonial.
* La esclavitud.
* El predominio de la iglesia Católica en todas las esferas de la sociedad.
Estas características era incompatibles con el sistema republicano instaurado en Santo Domingo desde 1822 con la unificación a Haití. La independencia de 1844 no había variado estos aspectos esenciales.
La inseguridad de los diferentes gobiernos conservadores, sobre todo Santana y Baez, frente al conflicto militar con Haití y frente a la oposición interna, reforzaron las gestiones anexionistas. Entre los principales conflictos internos que se dieron estaban los siguientes:
* De tipo ideológico: enfrentamientos entre liberales y conservadores.
* De tipo político:enfrentamientos entre seguidores de caudillos, como los baecistas y los santanistas.
* De tipo regional: pugnas entre regiones con características económicas diferente, como el sur y el Ciabao.
Generalmente el sector que estaba en el poder, ante el peligro de ser derrotado por una facción contraria, recurría a la negociación con una potencia extranjera buscando apoyo militar y político para mantenerse en el poder. Los opositores también recurrían al apoyo extranjero para sacar del poder a un sector. Un ejemplo de esto fue la llamada matricula de Segovia (segundo gobierno de Santana).

Una de las causas por la que los anexionistas no lograron sus planes antes fue porque potencias como España, Gran Bretaña y Estados Unidos presionaban a través de sus cónsules y sus cancillerías, cuando sabían de los intentos de protectorado y anexión. Santana y su grupo pensaban que una vez se produjera la anexión, vendría una gran prosperidad. Olvidaban las experiencias anteriores durante los siglos XVI y XVII y durante la España Boba, cuando Santo Domingo vivió en medio de una gran pobreza y el desinterés de la metrópoli.

Santana y las gestiones de la anexión.
Santana, argumentando la inminencia de una invasión haitiana, había retomado sus gestiones de un protectorado con España. En 1859, el general Felipe Alfau, hombre de confianza de Santana, inicio las negociaciones de un con la reina de España, Isabel II. Alfau le planteo a España los beneficios que podría obtener mediante un protectorado sobre nuestro país. Elmismo Santana escribió una carta a la reina en la que expresaba su interés, no de un simple protectorado, sino de la anexión a España.
La nación ibérica tenía importantes motivos que hacían que le interesara la anexión. España mantenía como colonias a Cuba y Puerto Rico. Ocupar Republica Dominicana la ayudaría a afianza su posición geopolítica en el Caribe, amenazada por el creciente poderío y expansionismo norteamericano. Ademas, el país constituira una excelente fuente de materias primas. El proyecto fue impulsado por el exitoso expansionismo que en esos momentos tenia España en Africa, bajo la gestión del ministro de Guerra, Leopoldo O’Donnell.
A partir de 1860, empezaron las visitas de funcionarios españoles que prepararon el terreno para el acuerdo. En julio, visito el país Joaquín Gutiérrez de Rubalcava, enviado por el gobernador cubano Francisco Serrano. Su propósito era conocer la situación económica, política y social del país y determinar si era conveniente una anexión. Las autoridades dominicanas se aseguraron de que este se llevara una impresión positiva. La respuesta de Rubalcava fue favorable, lo que abrió las puertas del proceso hacia la anexión a España.
Anexión de Santana.
Pedro Santana, aunque siempre se considero español, había sido partidario de la anexión a Estados Unidos porque consideraba que esta nación seria de gran importancia en un futuro cercano. Estados Unidos no pudo atender esta solicitud porque estaba practicamente al borde de una guerra civil llamada la guerra de secesión.