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Estructura molecular: Diseño de RNA; Entrenamiento de RNA; Analisis Predictivo RNA - ingeniera quimica



ACD/ChemSketch Matlab-RNA Component Plus LabView

Predicción de propiedades críticas y basicas usando Redes Neuronales Artificiales Tipo Backpropagation
Predict Critical and Basic Properties Using Artificial Neural Networks type Backpropagation
By Wilmer S, Collantes@,GENio
Chemical Engineering Department, Faculty of Chemical and metallurgy Engineering, University Jose Faustino Sanchez C
Centro de Información Tecnológica (CIT), UNSACA / Huacho / Perú
Website : https://es.geocities.com/CollantesIngenieria

Abstract

En el diseño de procesos tanto a escala industrial como de laboratorio se requieren datos termodinamicos y de las propiedades físicas de los compuestos químicos que intervienen en los mismos. El acceso a parametros basicos de temperaturas de transición de fase o de las propiedades críticas de los compuestos, resulta crucial en procesos petroquímicos, de destilación y de tratamiento de desechos, entre otros. Las bases de datos existentes (DIPPR, Belstein, Detherm) constituyen la fuente de información primaria de dichos datos. Sin embargo, en los casos relacionados con diversos productos naturales o con la predicción del impacto medioambiental, la información existente es escasa o en muchos casos inexistentes. Las razones pueden serdiversas, partiendo de las dificultades implícitas en el método experimental utilizado para obtener los parametros cuantitativos, o la inviabilidad del método, por que requiera una considerable inversión de tiempo y/o dinero. Es por ello, que la búsqueda de métodos alternativos para estimar propiedades físicas, químicas y biológicas es un campo ampliamente explorado. Uno de los métodos utilizados recientemente con este fin, son los métodos basados en las relaciones estructura-propiedad.



Keywords: Estructura molecular: Diseño de RNA; Entrenamiento de RNA; Analisis Predictivo RNA

1. El Problema
La búsqueda cuantitativa de la relación entre la estructura de un compuesto y una propiedad específica es en esencia un problema de regresión. Históricamente, la regresión multilineal, el analisis de componentes principales y de mínimos cuadrados parciales han sido los métodos mas empleados en el desarrollo de los modelos basados en estructura-propiedad. Sin embargo, uno de los inconvenientes lo encontramos al tener que asumir a priori la propia forma del modelo. El hecho de fijar una relación lineal entre los descriptores moleculares que caracterizan a la estructura molecular y la propiedad que se esta modelando, no implica que esta se cumpla o que el modelo obtenido sea el óptimo.

2. La solución
Las relaciones estructura propiedad pueden modelarse con otras técnicas dereconocimiento de patrones como las redes neuronales. En muchos casos, han demostrado dar mejores resultados que los métodos tradicionales debido a su

- Habilidad de tratar con las no-linealidades inherentes en las relaciones estudiadas.
- Capaces de producir resultados razonables aún cuando se carezca de alguno de los datos de entrada o dichos datos presente ruido.
- Capacidad de generalizar los resultados a nuevos datos no presentados durante la fase de entrenamiento de la red.
14) CH2 = CH-CH3 (    ) 15) CH2=CH2 (   ) 16) CH3-CH2-C CH (   )
17) C4H10 (   ) 18) C2H6 (   ) 19) C2H4 (   ) 20) C5H12 (    ) 21) C2H2 (    )
22) C9H18 (    ) 23) C3H4 (   )

Nomenclatura Alcanos.
En el sistema IUPAC, los alcanos lineales se nombran dependiendo del número de carbonos con la terminación ano como se muestra en la siguiente tabla:
Nombre | Número de atomos de carbono | Fórmula CondensadaCNH2N+2 | Fórmula Semidesarrollada |
metano | 1 | CH4 | CH4 |
etano | 2 | C2H6 | CH3CH3 |
propano | 3 | C3H8 | CH3CH2CH3 |
butano | 4 | C4H10 | CH3(CH2)2CH3 |
pentano | 5 | C5H12 | CH3(CH2)3CH3 |
hexano | 6 | C6H14 | CH3(CH2)4CH3 |
heptano | 7 | C7H16 | CH3(CH2)5CH3 |
octano | 8 | C8H18 | CH3(CH2)6CH3 |
nonano | 9 | C9H20 | CH3(CH2)7CH3 |
decano | 10 | C10H22 | CH3(CH2)8CH3 |
undecano | 11 | C11H24 | CH3(CH2)9CH3 |
dodecano | 12 | C12H26 | CH3(CH2)10CH3 |
tridecano | 13 | C13H28 | CH3(CH2)11CH3 |
tetradecano | 14 | C14H30 | CH3(CH2)12CH3 |
pentadecano | 15 | C15H32 | CH3(CH2)13CH3 |
hexadecano | 16 | C16H34 |CH3(CH2)14CH3 |
heptadecano | 17 | C17H36 | CH3(CH2)15CH3 |
octadecano | 18 | C18H38 | CH3(CH2)16CH3 |
nonadecano | 19 | C19H40 | CH3(CH2)17CH3 |
eicosano | 20 | C20H42 | CH3(CH2)18CH3 |

Nomenclatura Alquenos.
En el sistema IUPAC, los alquenos se nombran como los alcanos, pero se reemplaza la terminación ano por eno: ejemplo el etano cambia a eteno.
A partir de 4 carbonos se enumeran los carbonos del extremo mas próximo al doble enlace, se indica la posición del enlace doble siendo este el menor de los dos carbonos que lo contienen con la terminación correspondiente de los alquenos.
Nombre | Número de atomos de carbono | Fórmula CondensadaCNH2N | Fórmula Semidesarrollada |
eteno | 2 | C2H4 | CH2 = CH2 |
propeno | 3 | C3H6 | CH2 = CH2 - CH3 |
1 buteno | 4 | C4H18 | CH2 = CH2 – CH2 - CH3 |
2 penteno | 5 | C5H10 | CH3-CH2 = CH2 –CH2 -CH3 |
3 hexeno | 6 | C6H12 | CH3-CH2-CH2=CH2-CH2–CH3 |

Nomenclatura Alquinos.
Para nombrar los alquinos se sigue el sistema IUPAC como se hizo con los alcanos cambiando la terminación -ano por -ino. Ejemplo si se tiene dos carbonos como alcano es etano, en los alquinos es etino.
La posición del triple enlace en la cadena se especifica por un número de forma similar a la usada en la nomenclatura de los alquenos.
Nombre | Número de atomos de carbono | Fórmula CondensadaCNH2N-2 | Fórmula Semidesarrollada |
etino | 2 | C2H2 | CH Ξ CH |
propino | 3 | C3H4 | CH Ξ CH2 - CH3 |
1 butino | 4 | C4H6 | CH Ξ C – CH2 - CH3 |
2 butino | 4 | C4H6 | CH3 - C Ξ C – CH3 |

3. Descripción
Las redes neuronales artificiales han sido usadas en este trabajo para predecir las propiedades críticas (temperatura, presión, volumen) ademas de la temperatura de ebullición y el factor acentrico de sustancias organicas puras a partir de las relaciones estructura-propiedad utilizando Redes de Perceptrones con aprendizaje supervizado tipo backpropagation con algoritmo Levenberg-Marquardt. Los datos desde la literatura de las propiedades críticas y basicas de 250 sustancias han sido usados para el entrenamiento de la R.N.A. La Investigación se centra en el estudio de la mejor topología de la red para la predicción. Los resultados demuestran que la topología 9:16:4 (9 entrada propiedades estructurales, 16 neuronas, para predecir 4 propiedades) predice mejor que los otras topologías en este estudio.

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Imagen a) Cafeína b)Cumaraina (Haba)

ChemSketch, Diseño de la estructura

Matlab, Estructura de la capa 1 de la red neuronal artificial


LabVIEW, Panel de ingreso de propiedades estructurales


LabVIEW, Panel Predicción de las propiedades criticas y basicas.
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En las redes neutrales biológicas, las células neuronales (neuronas) representan a los elementos de procesamiento. Las interconexiones se realizan por medio de las ramas de salida (axones) que producen un número de variable de conexiones (sinapsis) con otras neuronas. Biológicamente, las redes neuronales estan construidas de forma 3D por componente microscópicos. Estas neuronas parecen ser capaces de interconectarse sin ninguna restricción. Esto no es posible en las redes neurales artificiales las cuales son un simple conglomerado de neuronas artificiales primitiva

Las neuronas se distribuyen creando capas, las cuales se conectan unas con otras. Como es esta conexión varía de un tipo de red a otra. La capa de entrada consiste en una serie de neuronas que reciben la información de entrada del exterior. La capa de salida consiste en una serie de neuronas que comunican la respuesta del sistema al usuario o ambiente exterior. Usualmente hay un número de capas intermedias (ocultas) entre estas dos capas.


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