Clasificación de Algas
Las algas constituyen un conjunto polifilético, es decir, sus miembros estan dispersos entre distintos grupos de parentesco (grupos monofiléticos). Para su ordenación en divisiones y clases se han utilizado características como la composición de los pigmentos, de las sustancias de reserva, de la pared celular y las características de la división celular.
Hay algas procariotas y eucariotas.

Algas Procariotas
Actualmente se considera que toda alga es eucariota. Sin embargo, tradicionalmente se han considerado también algas a un sólo grupo, el de las cianobacterias.
Cianobacterias: Único grupo procariota que ha sido tratado habitualmente bajo el concepto de algas: Llamadas tradicionalmente algas verdeazuladas, que es lo que literalmente significa su antiguo nombre sistematico de cianofíceas.

Algas Eucariotas
Estan considerados habitualmente como protistas o como plantas según los sistemas de clasificación. Evolutivamente se pueden clasificar en dos grupos principales: losdescendientes de Primoplantae por adquisicición primaria de los cloroplastos y las algas cromofitas.
Primoplantae: Son filos emparentados entre sí y son los llamados eucariontes fotosintéticos primarios, descendientes directos del protozoo biflagelado en cuyo seno una cianobacteria se convirtió en el primer cloroplasto.
1. Glaucofitas : Son algas unicelulares de agua dulce que se caracterizan por contener cianelas.
2. Algas rojas : En algunas clasificaciones se clasifican dentro de Plantae.
3. Algas verdes: De donde evolucionaron las plantas terrestres. Se suelen clasificar dentro del reino Plantae, subreino Viridiplantae.

Algas cromofitas: Son aquellas cuyos cloroplastos provienen de un alga roja por endosimbiosis secundaria. Estos cloroplastos son llamados también rodoplastos y contienen mas pigmentos secundarios y clorofila c. Aún no estan del todo claras las relaciones filogenéticas, pues podrían ser un grupo monofilético denominado Chromista o ser polifilético producto de eventos simbióticos independientes.
Ciclo del azufre

El sulfato es la forma biológicamente disponible por los autótrofos incorporada a las proteínas, es esencial para ciertos aminoacidos. El azufre no se requiere en grandes cantidades pero su ciclo es clave para la producción y descomposición general.
El proceso es importante en zonas anaerobias profundas de suelos y aguas por descomposición de proteínas pasando a dióxido, sulfatos; reflejan la luz solar contribuyendo a las temperaturas actuales.
Los ciclos del nitrógeno y del azufre son afectados por la contaminación ambiental industrial. Elsulfato es un componente natural en el ciclo pero es tóxico en diversos grados. El azufre en sus diferentes formas contribuye a la formación del smog y son productores de la lluvia acida a que provienen de las emisiones automotrices y combustión en general formando acido sulfúrico.

Ciclo del Carbono

El carbono tiene pequeñas reservas atmosféricas que son muy vulnerables, existe mayormente en los océanos, combustibles fósiles y en la litosfera.
De 1850 para aca el CO2 ha aumentando peligrosamente y ha provocado un mayor efecto invernadero. El mar es un amortiguador eficaz del CO2 ya que el mar y la atmósfera se equilibran mutuamente y es su principal mecanismo de control.
Existen tres formas de carbono presente CO2, CO Y CH4. Los dos últimos surgen como producto de la descomposición de materia organica y se oxidan a CO2. El CH4 absorbe 25 veces mas calor que el CO2, por lo tanto puede aumentar el calentamiento mundial.
Ciclo Hidrológico

El ciclo del agua incluye el desplazamiento del agua de los océanos a la atmósfera (evaporación) a la tierra (lluvia) y de nuevo a los océanos (lixiviación e infiltración). La tercera parte de la energía solar sirve como impulsor del este ciclo.
Se evapora mas agua de la que llega por la lluvia. Las actividades humanas aumentan la tasa de lixiviación reduciendo la recarga de mantos acuíferos.
Pulso de inundación: avance y retroceso anual enaguas de inundación, extiende el río y los nutrientes sobre la planicie. Concepto del discontinuo del río: ríos tienen muchas presas por lo que las presas de los ríos pequeños se estan destruyendo. Corriente en espiral: reciclado de elementos esenciales entre los organismos y acervos disponibles corriente abajo.

Tiempos de recambio y residencia

La tasa de recambio: fracción de la cantidad total de sustancia en un compartimiento que se libera en un periodo. Tiempo de recambio: tiempo necesario para reemplazar una cantidad de sustancia igual a su cantidad en el compartimiento. Tiempo de residencia: tiempo en que una sustancia permanece en una residencia.

Tiempo de recargo es importante ya que con el conocemos si un tiempo de recargo esta dado en un equilibrio y con la sincronización. Si es ciclo es acíclico entonces se hara mas complejo el estudio de los mismos. Las reservas se encuentran limitadas. Los isótopos radiactivos pueden utilizarse como marcadores. Los compartimentos influyentes con el suelo, la tierra, el agua, hay un flujo entre ellos, lo cual ayuda a mantener los equilibrios.

Biogeoquímica de las cuencas

La cuenca es un tipo de ecosistema mínimo o unidad de paisaje, los estudi